微星的这款主板不仅在硬件上提升明显，同时在软件部分也为用户增加了很多全新的功能。在主板自带的驱动光盘中，附带了很多功能强大的软件，其中包括带有主板灯光调节功能的GAMING APP，以及带有超频、监测等功能的控制中心，还包括定制化的CPU-Z以及音频驱动程序等。

LED灯光调节功能

LED灯光实拍

　　微星X99A GAMING PRO CARBON的表面覆盖了数量众多的LED灯，同时这些LED灯支持17种灯光模式及1680万色显示。主板的每个CPU、PCI插槽、音频、背板、南桥等区域都可以通过这款软件来分别设置灯光模式，可根据机箱、内存、显卡等设备的相关配色来调整灯光颜色及模式，极大地满足了用户定制化的外观需求。

实时监测功能

定制化音频驱动界面

视频游戏同步功能

　　另外，主板还提供了一款名为DRAGON EYE的软件，这款软件支持玩家们在运行游戏的同时播放游戏视频，播发的游戏视频将以画中画的形式呈现在游戏画面上，对于需要参照视频攻略进行游戏的玩家来说，使用这款软件极大的增强游戏进程推进效率。